Chuyển phôi là một thủ thuật đơn giản, giống như là xét nghiệm tầm soát cổ tử cung (phết tế bào tầm soát). Số lượng phôi được chuyển và quy trình có thể thay đổi tuỳ trung tâm. Thủ thuật có thể tiến hành bởi bác sĩ hiếm muộn hay y tá hiếm muộn :
- Họ đặt mỏ vịt vào âm đạo để tách các thành âm đạo ra
- Một ống mỏng, dài (catheter) được đưa vào âm đạo, vào cổ tử cung – bác sĩ có thể dùng siêu âm để hướng dẫn đưa catheter chuyển phôi vào đúng vị trí.Catheter có chứa phôi được chọn và gắn vào một xi lanh
- Bác sĩ hiếm muộn sẽ nhẹ nhàng bơm phôi vào tử cung nhờ vào catheter
Toàn bộ quy trình chuyển phôi chỉ kéo dài khoảng 15 phút. Thông thường không cần tiến hành gây mê toàn thân khi tiến hành chuyển phôi trừ một số trường hợp đặc biệt. Bệnh nhân có thể xuất viện trong ngày, nhưng có thể được khuyên nghỉ ngơi sau đó.